Фамилия Гардюшин — одна из тех, где за привычным звучанием скрывается неочевидная основа. Если разобрать её по составу, то сразу бросается в глаза суффикс -ин, который в русских фамилиях обычно указывает на принадлежность: «чей?» — Гардюшин, то есть сын или потомок Гардюши. А вот с корнем сложнее: слова «гардюша» в литературном русском языке нет.

Самая вероятная версия — фамилия происходит от прозвища Гардюша, которое, в свою очередь, восходит к диалектному глаголу «гардеть» или «гардыбачить». В южнорусских и украинских говорах эти слова означали «громко кричать, шуметь, буянить» или «важничать, задираться». Соответственно, Гардюшей могли прозвать человека крикливого, неуживчивого или, наоборот, того, кто любил покрасоваться. Это прозвище из разряда «по характеру» — таких в крестьянской среде было множество.

Вторая, менее распространённая гипотеза связывает корень с тюркскими языками. В некоторых тюркских наречиях «гарды» означает «снег, буран», а «гардыш» — «снежный, зимний». Если это так, то прозвище могло относиться к человеку, родившемуся в сильную метель или имевшему отношение к зимним работам. Однако для русской фамилии эта версия слабее: суффикс -уш- (-юш-) в прозвище Гардюша — типично славянский уменьшительный (сравните: Ванюша, Гаврюша), что указывает на славянское, а не тюркское происхождение основы.

Фамилия редкая и географически привязана в основном к центральным и южным регионам России — встречается в Воронежской, Ростовской областях, а также в Поволжье. В документах XVII–XVIII веков она не зафиксирована, что говорит о её относительно позднем оформлении: скорее всего, фамилия закрепилась за крестьянами или однодворцами уже после отмены крепостного права, когда прозвища массово становились официальными фамилиями.

Стоит обратить внимание на ударение: в фамилии оно падает на второй слог — Гардю́шин. Если бы ударным был первый слог (Га́рдюшин), это могло бы указывать на другую основу, но в данном случае форма Гардю́ша — это производное с суффиксом -юш- от корня «гард-», что и подтверждает связь с диалектным «гардеть».