Фамилия Гарсаян — редкий пример фамилии, которую почти наверняка принесли на русскую почву из Закавказья, но при этом она звучит не по-армянски и не по-грузински в привычном смысле. Основа здесь — Гарса, и чтобы понять её происхождение, нужно смотреть не в сторону типичных русских суффиксов, а в сторону тюркских и кавказских языков. Скорее всего, перед нами армянская фамилия, образованная с помощью суффикса -ян (патронимический, «из рода такого-то»), но корень у неё не армянский, а заимствованный.

Самая правдоподобная версия возводит Гарса к тюркскому прозвищу или имени. В тюркских языках есть слово «гарсы» или «карсы», которое может означать «противоположный», «враждебный», «упрямый», а также «крест-накрест» (в значении «перекрёсток» или «пересечение»). Если предок получил прозвище Гарса за неуступчивый, спорный характер или за то, что жил на перепутье, то его дети уже записывались как Гарсаяны. Встречается и другая, более экзотическая гипотеза: связь с названием древнего города Карс (историческая армянская область), но тогда фамилия скорее звучала бы как Карсян или Карслян, а «Гарсаян» — это уже местный диалектный вариант или искажение при записи.

В русском контексте фамилия Гарсаян — однозначно поздняя, она не могла возникнуть в центральной России. Её носители — это, как правило, потомки армян, переселившихся в Российскую империю или СССР из Закавказья, где тюркские имена и прозвища были обычным делом среди армянского населения. Встречается она в основном в Краснодарском крае, Ростовской области и Ставрополье — регионах, где исторически сложились крупные армянские общины. Аналогов по модели образования много: те же Арутюнян, Петросян, но с тюркской основой — например, фамилия Агаян (от «ага» — господин) или Балаян (от «бала» — дитя). Гарсаян стоит в том же ряду: армянская фамилия с неармянским корнем, что говорит о сложной этнической истории предков.