Фамилия Гайниахметова — женская форма мужской фамилии Гайниахметов. Она образована от сложного арабско-тюркского мужского имени Гайниахмет, которое можно разобрать на две части: «гайн» (араб. «глаз», «источник», «родник») и «ахмет» (тюркская форма имени Ахмад, «самый восхваляемый», один из эпитетов пророка Мухаммеда). В буквальном смысле имя Гайниахмет означает «источник похвалы» или «родник восхваления» — типичная для мусульманской ономастики образная конструкция, где первая часть усиливает или конкретизирует значение второй.

По словообразовательной модели фамилия относится к самому массовому русскому типу на -ов/-ев, который в Поволжье и Приуралье активно адаптировал тюркские и арабские имена. Суффикс -ов здесь указывает на принадлежность: «Гайниахметов» — сын Гайниахмета, потомок человека с таким именем. Встречается и вариант написания через дефис (Гайни-Ахметов), но в современной русской орфографии фамилия чаще пишется слитно, как одно слово.

Географически фамилия Гайниахметова (и её мужская пара) распространена почти исключительно среди татар и башкир. Основной ареал — Республика Татарстан, Башкортостан, а также Оренбургская и Челябинская области. Встречается и у казахов, но реже — у них более употребительны формы вроде Гайниахмет или Гайнахмет без русского суффикса. В дореволюционных метрических книгах фамилия фиксируется с конца XIX века, преимущественно среди крестьян и торговцев в уездах Уфимской и Казанской губерний.

С точки зрения социального контекста, носители имени Гайниахмет в XIX веке нередко были муллами или деревенскими грамотеями — имя считалось книжным, религиозным, его давали в честь уважаемых предков. Однако фамилия не указывает на сословную принадлежность: её могли носить и крестьяне, и купцы, и духовные лица. Сейчас Гайниахметова — фамилия не слишком частая, но устойчивая; её носители живут в основном в тех же регионах, где она возникла, и редко встречаются за пределами Урало-Поволжья.