Фамилия Гендрусев — один из примеров, когда русская по форме фамилия имеет балтское, а именно литовское, происхождение. В её основе лежит мужское имя Гендрус, которое восходит к литовскому слову giedras — «ясный, светлый». Это имя было известно в литовской истории: его носил один из литовских князей. Таким образом, фамилия образована по классической восточнославянской модели с суффиксом -ев, который присоединялся к основам на мягкий согласный. Потомок человека по имени Гендрус со временем стал Гендрусевым.

Суффикс -ев указывает на принадлежность: «чей?» — Гендрусев, то есть сын или потомок Гендруса. Такая модель была особенно распространена в среде служилых людей и крестьянства, где фамилии часто закреплялись по имени отца. Примечательно, что литовский корень giedras родственен и некоторым славянским словам со значением «чистый, ясный», что делает значение фамилии прозрачным даже для носителя русского языка: предок мог получить прозвище за светлый нрав, ясный взгляд или светлые волосы.

Встречаются ли фамилия Гендрусев в современных справочниках? Данных о её широкой географии или известных носителях нет. Это редкая фамилия, что характерно для случаев, когда основой стало личное имя, не вошедшее в русский именник. Скорее всего, её носители — потомки выходцев из Великого княжества Литовского, которые оказались в русскоязычной среде и адаптировали свою фамилию под привычную словообразовательную норму.