Фамилия Гендрусев — один из примеров того, как литовские корни прижились на русской почве, оформившись по модели русских отчеств. В основе фамилии лежит литовское мужское имя Гендрус, которое восходит к слову giedras — «ясный, светлый». Это имя не было случайным: по преданию, его носил один из литовских князей, что придаёт фамилии налёт древности и знатности.

Словообразовательная модель проста: к основе Гендрус- добавился типичный русский суффикс -ев, образующий фамилии от имён, оканчивающихся на согласный. Так «Гендрус» превратилось в «Гендрусев» — буквально «сын Гендруса». Форма на -ев, а не на -ов, объясняется мягкостью конечного согласного в исходном имени.

Географически фамилия тяготеет к западным регионам России, где исторически было сильное литовское и балтское влияние — например, к Смоленской, Псковской или Тверской губерниям. Точное время её возникновения назвать сложно: фамилии у крестьян и мещан закрепились в основном к XVIII–XIX векам, но отдельные носители княжеского имени могли появиться и раньше. В любом случае, Гендрусевы — это редкий пример того, как балтское имя, выйдя из княжеской среды, со временем стало родовым знаком для потомков, независимо от их сословной принадлежности.