Фамилия Генис образована от личного имени, которое в русской традиции закрепилось в форме Гинес или Генис. Исходная латинская форма — Genesius, восходящая к греческому слову gennēsios, что означает «знатный», «родовитый» или «законнорожденный». Таким образом, в основе фамилии лежит прозвище или имя, указывающее на благородное происхождение или статус законного наследника.

Интересно, что имя Генис встречается в Каталонии, что даёт ключ к возможной географии фамилии. Не исключено, что основатель рода Генис был сефардом — испанским евреем, носившим это имя. После изгнания евреев из Испании в конце XV века сефарды расселились по Средиземноморью, и фамилия могла попасть в Восточную Европу вместе с миграционными волнами.

Словообразовательная модель фамилии проста: суффикс -с отсутствует, перед нами чистая основа имени без патронимического окончания (-ов, -ин, -ский), что нетипично для русских фамилий, но характерно для фамилий, пришедших из западноевропейских языков или идиша. В русской среде такая форма могла закрепиться без изменений, как это часто бывало с иноязычными именами.

С точки зрения ономастики, фамилия Генис относится к группе фамилий, образованных от календарных имён, но не через церковнославянскую, а через латинскую или греческую традицию. Имя Genesius известно в христианских святцах (например, святой Генезий, актёр-мим, принявший мученичество), что добавляет ещё один возможный путь появления фамилии — через христианскую ономастику в романских странах.

Сравнение с однокоренными фамилиями показывает, что в русском языке встречаются варианты Генезис, Генисов, но фамилия Генис без суффикса — редкий случай. Это может говорить о том, что предки носителя фамилии долгое время жили в среде, где не было принято русифицировать окончания (например, в еврейских местечках или среди иностранных переселенцев).