Фамилия Гермогентова происходит от полной формы церковного имени Гермогент (в обиходе — Гермоген). Это редкий случай, когда фамилия сохранила архаичную основу на -т, что выдает её книжное, а не народное происхождение. В переводе с греческого имя означает «потомок Гермеса» — бога торговли, ловкости и красноречия, что в христианской традиции переосмыслялось как «разумный» или «одарённый словом».

Словообразовательная модель здесь — притяжательный суффикс -ов, присоединённый к полному имени. Это указывает на то, что фамилию дали не от уменьшительной или обиходной формы (как, скажем, Ермошин или Ермаков), а от официального, паспортного имени. Такая модель характерна для духовного сословия: в семинариях и академиях XVIII–XIX веков нередко давали фамилии по именам святых или по греко-латинским канонам. Гермогентовы, скорее всего, происходят из среды церковнослужителей или образованных горожан, а не крестьян.

Небесным покровителем имени считается мученик Гермоген, пострадавший за Христа около 312 года. Согласно житию, он начинал как гонитель христиан, но после встречи с верой обратился сам и был обезглавлен. Этот сюжет подчёркивает, что имя в православной традиции не было массовым — оно оставалось редким, «учёным», что и отразилось в фамилии.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным губерниям России, где было сильно влияние церковных школ. Встречается она и сейчас, но крайне редко — в основном на юге России и в Москве. Женская форма Гермогентова, как правило, принадлежит потомкам по женской линии или является исходной для замужних женщин в старых записях.

В отличие от распространённых фамилий на -ов от мирских имён (Иванов, Петров), Гермогентова — явный маркер книжной культуры. Если ваш предок носил эту фамилию, он с высокой вероятностью был либо священником, либо выходцем из духовного звания, получившим фамилию при поступлении в семинарию. Никакой иной, крестьянской или ремесленной, версии происхождения у этой фамилии нет — слишком редкое и длинное имя для простонародья.