Скорее всего, фамилия Гисса восходит к южнонемецкому слову giesse - «водопад», «стремительный поток». Следовательно, прозвище Гисс, послужившее основой для этой фамилии, мог получить человек, живший возле водопада или на берегу бурной реки. Менее вероятно, что фамилия Гисса связана с глаголом gissen - «определять местонахождение судна». В этом случае основатель рода Гисса мог быть штурманом. Конечный «а» объясняется влиянием украинского языка.