Фамилия Гизунов звучит редко, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, она образована от прозвища или нецерковного имени Гизун, а оно, в свою очередь, могло возникнуть от диалектного глагола «гизать» — в некоторых русских говорах это означало «визжать», «пищать» или «кричать пронзительно». Такое прозвище могли дать человеку с резким, высоким голосом, либо тому, кто много и громко говорил. Суффикс -ун в русских прозвищах типичен для характеристики по действию: болтун, крикун, ворчун. Гизун — тот, кто гизает.

Менее вероятная, но возможная версия связывает основу с тюркским словом «гиз» (девушка, девица). В этом случае Гизуном могли прозвать человека, который воспитывался в окружении женщин или имел какие-то «девичьи» черты поведения. Однако эта версия слабее, потому что прозвища по такому признаку в русской среде почти не встречаются, а фамилии на -ов от тюркских основ обычно образуются от мужских имён (например, Абдулов, Ибрагимов), а не от нарицательных слов с таким значением.

Фамилия оформлена по стандартной русской модели: суффикс -ов указывает на принадлежность — «сын Гизуна». Это типичная патронимическая фамилия, которая закрепилась в центральных и южных регионах России. Встречаемость её крайне низкая, и в дореволюционных списках она почти не фигурирует, что говорит о её локальном бытовании, возможно, в среде однодворцев или крестьян одной волости.

В написании фамилии обращает на себя внимание корень «Гиз-», который не характерен для славянских антропонимов. Это дополнительный аргумент в пользу диалектного происхождения: такие слова редко попадают в литературный язык, но живут в говорах. Если искать однокоренные фамилии, то ближе всего стоит Гизов (от Гиз — краткая форма имени или прозвища), но Гизунов отличается именно суффиксом -ун, который придаёт прозвищу оттенок активного действия.

Таким образом, предок носителя фамилии Гизунов, скорее всего, получил своё прозвище за голос — звонкий, пронзительный или беспокойный. Фамилия сохранила редкую диалектную черту и не имеет отношения к знатным родам: её носители, вероятно, были крестьянами или посадскими людьми из регионов, где бытовало слово «гизать».