Фамилия Глистогонов — редкий случай, когда прозвище-основа сохранило прямую, почти медицинскую связь с действием. Вопреки возможному подозрению в иносказательности, здесь всё буквально: «глистогон» — это народное название средства, выводящего паразитов (от слов «глист» и «гнать»). Так могли прозвать знахаря, лекаря или просто человека, который успешно избавлял от глистов — скорее всего, в крестьянской среде, где такие проблемы были повседневностью.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: суффикс -ов указывает на принадлежность. Глистогонов буквально означает «сын Глистогона» или «из рода Глистогоновых». Фамилия образована от прозвища, а не от имени, и это сразу говорит о её позднем происхождении — скорее всего, не ранее XVII–XVIII веков, когда прозвища, связанные с ремеслом или бытовыми особенностями, активно превращались в наследственные фамилии.

Интересно, что в отличие от «лекарских» фамилий вроде Лекарев или Докторов, Глистогонов не указывает на официальную профессию. Это народное, «низовое» прозвище, которое могли дать не за диплом, а за реальный навык. В говорах слово «глистогон» бытовало и как название растения (например, пижмы или полыни), но вряд ли прозвище давали по растению — скорее по действию.

Географически фамилия не привязана к одному региону, но встречается редко, в основном в центральных и южных областях России. В дореволюционных списках и переписях она почти не фиксируется, что подтверждает её позднее оформление и низкое социальное происхождение — носителями были крестьяне, получившие фамилию при освобождении от крепостной зависимости в середине XIX века.

В современных базах данных Глистогоновых немного, и это одна из тех фамилий, которые при всей своей неблагозвучности для неподготовленного уха несут чёткую профессиональную или прозвищную историю. Никакой двусмысленности: предок был тем, кто «гнал глистов», и это занятие закрепилось за родом.