Фамилия Годеновский — одна из тех, что сразу указывает на географическое происхождение. Её основа — топоним, название места, где жил или откуда был родом основатель рода. Суффикс -ский в русских фамилиях традиционно присоединялся к названиям населённых пунктов, образуя так называемые «географические» фамилии, которые в старину часто носили дворяне, духовенство и выходцы из западных земель.

Исходное название — Годеново. Такое село или деревня действительно существовали и существуют. Самое известное Годеново находится в Ярославской области, недалеко от Переславля-Залесского. Это место знаменито чудотворным Крестом, обретённым в XV веке, и Свято-Никольским женским монастырём. Однако фамилия могла возникнуть и от другого, менее известного поселения с таким же именем, разбросанных по центральной России.

Корень «годен» в названии села восходит к древнерусскому слову «годный» — то есть пригодный, удобный, подходящий для жизни. В старину так могли назвать участок земли, который хорошо подходил для пашни или поселения. Таким образом, фамилия Годеновский буквально означает «выходец из Годенова», а её первоначальный смысл — «принадлежащий к этому месту».

Словообразовательная модель проста: к основе «Годенов» (название села) добавился суффикс -ский, который в XV–XVII веках активно использовался для фамилий польско-литовского и западнорусского происхождения. Это не исключает, что фамилия могла сформироваться и в великорусских землях, где суффикс -ский тоже был распространён, особенно среди духовенства, бравшего фамилии по названиям приходов.

Других версий происхождения, заслуживающих серьёзного внимания, нет. Попытки связать фамилию с личным именем «Годен» (краткая форма от Годослав, Годемир) маловероятны: таких имён в русской антропонимии практически не зафиксировано, и суффикс -ский к личным именам присоединялся редко.

Фамилия редкая, не входит в списки самых частых русских фамилий. Её носители, скорее всего, происходят из крестьян или однодворцев Ярославской, Костромской или Владимирской губерний, где и расположены Годеновы. Дворянского титула за этой фамилией не числится, но по географическому принципу её обладатели могли быть и священниками при церкви в селе Годеново.