Фамилия Годубев — редкая и неочевидная. На слух она почти совпадает с распространённой «Голубев», но пишется через «д» и с «у» в корне. Это не опечатка и не народное искажение, а самостоятельная фамилия с другим происхождением.

Самая вероятная версия — отчество от прозвища Годуб. В русских говорах у слова «годуб» было два основных значения. Первое — «голубь» (южнорусское и украинское «голуб» через аканье дало «голуб», а затем и «годуб»). Второе — «годовалый бычок» или «годовалый телёнок», то есть животное, прожившее год. Оба значения могли стать прозвищем: ласковым — для кроткого человека, или насмешливым — для медлительного, увальня, похожего на молодого бычка.

Морфологически фамилия прозрачна: основа «Годуб» плюс патронимический суффикс «-ев», указывающий на принадлежность («чей?» — Годубев, то есть сын Годуба). Суффикс «-ев» здесь стоит после мягкого согласного «б», что типично для фамилий, образованных от основ на -б, -в, -м.

В отличие от массового «Голубева», фамилия Годубев крайне редка. Встречается преимущественно в южных областях России (Курская, Белгородская, Воронежская), где аканье и мягкое произношение согласных могли закрепить форму «Годуб» вместо литературного «Голубь». В документах XVII–XVIII веков, например, в переписных книгах южных уездов, изредка фиксируются крестьяне и однодворцы с прозвищем Годуб, но систематических записей фамилии до XIX века почти нет.

Вторая, менее вероятная версия — отчество от личного имени Годуб, которое могло быть производной формой от канонического имени Гавриил или от славянского имени Год (Годимир, Годослав). В этом случае Годуб — уменьшительное или обиходное имя, а фамилия — просто «сын Годуба». Но эта гипотеза слабее, так как имя Годуб не зафиксировано в святцах и редко встречается в древнерусских грамотах.

Итак, Годубев — фамилия-прозвище, скорее всего, от южнорусского слова «годуб» (голубь или годовалый бычок). Она говорит о региональных особенностях речи предков и о том, что фамилию дали не по птице, а по бытовому, живому прозвищу. Носителей её мало, и каждый случай стоит изучать отдельно — по месту жительства и архивным записям.