Фамилия Годулин — относительно редкий пример, где корень слова почти наверняка украинский, а не великорусский. В основе лежит прозвище Годуля, которое связывают с нарицательным «годуля» — «корм, еда». Если это так, то прозвище указывало на род занятий: предок мог быть поваром, кормильцем или, что вероятнее в крестьянском быту, человеком, отвечавшим за заготовку кормов для скота. Такая профессия была жизненно важной в хозяйстве, и её обладатель легко получал устойчивое прозвище.

Вторая версия отсылает к украинскому слову «годулка» — болгарскому струнному смычковому инструменту. Здесь Годулей могли прозвать либо музыканта, играющего на таком инструменте, либо мастера, который его изготавливал. Эта гипотеза менее распространена, но лингвистически допустима: чередование «л» и «л'» в диалектах встречается, а прозвища по музыкальным инструментам — обычное дело.

Фамилия образована по стандартной восточнославянской модели: к основе Годул- добавился патронимический суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — «Годулин сын»). Такой суффикс типичен для фамилий, образованных от основ на -а или -я. В отличие от фамилий на -ов, которые чаще встречаются у великорусов, модель на -ин распространена повсеместно, но в сочетании с украинским корнем она выдаёт регион формирования — скорее всего, южнорусские или украинские земли, где пересекались языковые традиции.

Интересная деталь: фамилия Годулин почти не встречается в центральных и северных областях России. Её география — преимущественно Курская, Воронежская, Ростовская области и восток Украины. Это косвенно подтверждает украинское происхождение основы. Других версий, например, от календарного имени или от тюркского корня, для этой фамилии нет — она держится на двух прозвищных гипотезах, из которых «пищевая» выглядит надёжнее за счёт прямой и понятной семантики.