Фамилия Гогенко — типичный образец украинской модели фамилий на -енко, где суффикс означает родство: «сын» или «потомок» человека, которого звали Гога. В основе лежит имя Гога — просторечная, народная форма канонического имени Георгий, что с греческого переводится как «земледелец». За этим именем стоит фигура святого великомученика Георгия Победоносца — воина, который при гонениях на христиан открыто назвал себя последователем Христа, обличил языческого царя и после страшных мучений был казнён в 303 году. Именно этот святой считается небесным покровителем имени.

Есть и другая версия, но она менее убедительна: прозвище Гога могли дать от глагола «гоготать» — то есть громко кричать или смеяться. Если следовать этой гипотезе, Гогой называли шумного, голосистого человека. Однако в ономастике предпочитают возводить подобные фамилии к крестильным именам, а не к редким прозвищам — это надёжнее и объясняет массовость фамилии. В любом случае, модель Гогенко прозрачна: суффикс -енко указывает на происхождение по отцу, и фамилию стоит читать как «сын Гоги».

Интересно, что украинский суффикс -енко в XVII–XVIII веках был характерен для казацкой старшины и мещанства, а позже распространился шире. Фамилия Гогенко — не самая частая, но её морфология не оставляет сомнений в украинских корнях. Сравните с однокоренными Гога, Гогин, Гоголев — все они восходят к тому же имени Георгий, но в разных славянских традициях.