Фамилия Гоготин — редкий пример, где фамилия образована не от имени, а от прозвища, основанного на звукоподражании. В её основе лежит корень «гогот-», который в русских говорах связан с громким, резким смехом или криком. «Гоготать» — значит хохотать во всё горло или, применительно к птицам, издавать характерный звук (гуси гогочут). Соответственно, прозвище Гогота могли дать человеку с громким, заразительным смехом либо тому, кто любил покричать и пошуметь. В некоторых диалектах слово «гогот» имело и более конкретное значение — так называли болтуна или пустомелю.

Фамилия оформлена по стандартной восточнославянской модели с суффиксом -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Гоготин буквально означает «сын Гоготы» или «человек из рода Гоготы». Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а или -я. Если бы основа звучала как «Гоготь», фамилия, скорее всего, приняла бы форму Гоготев, но форма на -ин подтверждает, что исходное прозвище было именно Гогота.

География фамилии неширокая. По данным открытых источников, Гоготины встречаются преимущественно в центральных и южных областях России, а также на Украине. Встречаемость невысокая, что говорит о локальном происхождении — скорее всего, фамилия возникла в одном или нескольких соседних сёлах и не получила массового распространения. В дореволюционных переписях эта фамилия могла фиксироваться в формах Гогатин или Гоготкин из-за диалектного произношения или ошибок писцов.

Любопытно, что у фамилии есть «птичья» параллель. В говорах «гогот» — это ещё и крик гуся, а сама птица в ряде регионов называлась «гоголь». Однако связывать Гоготина напрямую с гоголем (уткой-нырком) не стоит: суффикс -ин в этом случае указывал бы на «гоголиный», что маловероятно. Прозвище Гогота, скорее, относилось к человеку, а не к птице.

О дворянском происхождении фамилии Гоготин ничего не известно. В родословных книгах и списках служилого дворянства она не значится. Это типичная крестьянская или мещанская фамилия, которая закрепилась в XIX веке при массовом присвоении фамилий бывшим крепостным. Носитель такой фамилии мог быть обычным крестьянином, но с яркой чертой характера — громогласностью, весёлостью или привычкой много говорить.