Фамилия Голионко — редкий случай, когда написание выдаёт происхождение точнее, чем корень. Суффикс -енко (в украинском произношении — -онко) однозначно указывает на украинскую или южнорусскую среду, где такие фамилии в XVI–XVIII веках закреплялись за детьми и внуками. Форма «Голионко» вместо более привычного «Голенко» или «Голиенко» — это диалектный или фонетический вариант, который мог закрепиться в документах из-за особенностей местного говора.

Основа «Голион» (или «Голийон») восходит к прозвищу Голий, Голый. В восточнославянской традиции прозвище «Голый» давали не только бедняку, который «гол как сокол», но и человеку безбородому, лысому, или тому, кто ходил в рваной одежде. Слово «голь» в старорусском означало «беднота, нищие», но бытовое прозвище могло закрепиться иронично — за неопрятным видом, а не за реальным достатком. Суффикс -он- в основе (Голион) — типичный для украинских прозвищ с экспрессивным оттенком, как, скажем, «Гриць» → «Грицун». То есть Голион — это «Голый» с оттенком фамильярности или уменьшительности.

Можно предположить и менее очевидный вариант: от имени Голиаф через народное переосмысление. В библейских текстах имя великана Голиафа в просторечии иногда сокращали до «Голион», а суффикс -ко давал бы «Голионко» — «сын (или потомок) Голиона». Однако эта версия менее вероятна: фамилии на -енко обычно образуются от мирских прозвищ, а не от библейских имён в такой форме, и для неё нет подтверждений в известных ономастических словарях.

Географически фамилия Голионко тяготеет к юго-западным областям бывшей Российской империи — современная Украина, особенно Полтавщина и Черниговщина, где суффикс -енко доминирует. Встречается она нечасто, что говорит о локальном бытовании: вероятно, предки одного рода получили прозвище в небольшой общине и передали его дальше без массового распространения. Сословной принадлежности по фамилии не определить: носителями могли быть и казаки, и крестьяне, и мещане — прозвище «Голый» было бытовым, не связанным с привилегиями.

Таким образом, Голионко — это украинская фамилия, образованная от прозвища Голион (усиленная форма от «Голый») с патронимическим суффиксом -ко. Предок носителя, скорее всего, был человеком с характерной внешностью (лысый, безбородый) или жил в бедности, а его дети и внуки закрепили это прозвище как родовое имя.