Фамилия Голофеева — женская форма фамилии Голофеев, и в её основе лежит прозвище, которое звучало как Голофей. Словообразовательная модель здесь стандартная для русских фамилий: суффикс -ев присоединяется к основе, оканчивающейся на согласный (или -й, переходящий в -ев). В данном случае исходная форма — Голофей, где -ей — типичное окончание для прозвищ, образованных от прилагательных или существительных с помощью суффикса -ей (ср. Бледней, Хромей). Таким образом, Голофей — это человек, получивший прозвище по какому-то яркому признаку.

Само прозвище Голофей, скорее всего, связано с прилагательным «голый» в переносном смысле. В русских говорах «голофей» могли называть бедняка, человека без имущества, «голого» как сокол. В некоторых регионах так могли прозвать бритого или лысого, но это значение менее вероятно: для обозначения лысины чаще использовали другие корни (Лысой, Плешивый). Более правдоподобна версия о социальном или имущественном положении: предок носителя фамилии мог быть настолько беден, что его выделили прозвищем «голофей» — то есть «голяк», «бедняк».

Встречаются и альтернативные объяснения, но они менее надёжны. Например, связь с диалектным словом «голофей» в значении «ветреный, легкомысленный человек» (от «голова» + «фей» — нечто пустое). Однако такая версия не подкреплена широкой фиксацией в словарях. Более того, в ономастике известна фамилия Голофеев, и её носители встречаются в центральных и южнорусских регионах, что подтверждает прозвищное происхождение от бытового, а не редкого термина.

Географически фамилия Голофеева (и её мужская форма) не привязана к какой-то одной узкой области — она встречается в Тульской, Рязанской, Воронежской губерниях, что типично для фамилий, образованных от прозвищ, описывающих внешность или достаток. Сословного барьера у неё не было: прозвище могли дать и крестьянину, и мещанину, и даже служилому человеку, если он выделялся бедностью или необычным видом. В целом, фамилия Голофеева — это память о предке, которого в деревне или слободе знали как «голофея», то есть человека без излишков, возможно, даже бобыля.