Фамилия Голомонзин — редкая и сложная для однозначного толкования. Её основа, «Голомонз», не встречается в современных русских говорах как нарицательное слово, поэтому разгадку ищут в диалектной лексике, иноязычных заимствованиях или искажённых формах других слов.

Наиболее вероятная версия связывает корень с диалектным «голомя» — так в некоторых областях называли голень, берцовую кость или вообще длинную, оголённую часть чего-либо. Человек с прозвищем Голомонза мог быть долговязым, худым, с длинными ногами — прозвище давалось по яркой внешней примете. Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: «чей?» — сын Голомонзы, то есть Голомонзин. Это классическая модель русских фамилий XVI–XVII веков, особенно распространённая на севере и в центральных областях России.

Менее убедительна, но возможна версия о тюркском следе. В некоторых тюркских языках есть основа «голом» (например, в казахском «голом» — «пустынный, безлюдный»), но для образования фамилии с русским суффиксальным оформлением это маловероятно. Скорее, если фамилия и имеет иноязычные корни, то это могло быть искажённое при переписи имя или географическое название.

Написание фамилии — Голомонзин (с буквой «з» в середине) — тоже редкий маркер. В русских фамилиях чаще встречается сочетание «-зин» на стыке корня и суффикса (как в фамилии Пузин), но здесь «з» входит именно в основу прозвища, что дополнительно подчёркивает его нестандартность.

Сословная принадлежность первых носителей неясна. Фамилия не дворянская и не купеческая, скорее всего, она возникла в крестьянской или посадской среде. Географически её следы встречаются в основном в Поволжье и на Урале — регионах, куда в XVII–XVIII веках активно переселялись крестьяне из центральных губерний, унося с собой местные прозвища.