Фамилия Головега — яркий пример того, как прозвище, данное человеку, закрепилось за его потомками. В её основе лежит сложение двух слов: «голова» и «нога». Такие составные прозвища в русской традиции не редкость: вспомним Головотяп, Косолап, Вертишейка. Они обычно отражали какую-то заметную внешнюю черту, особенность походки или поведения.

Скорее всего, Головегой прозвали человека с непропорционально большой головой на тонких, длинных ногах. Это могла быть шутливая, но меткая характеристика, данная в быту. Другая версия, менее распространённая, связывает фамилию с глаголом «головежить» — в некоторых говорах это означало «бездельничать», «слоняться без дела». Тогда прозвище могло относиться к человеку медлительному или рассеянному.

Фамилия образована без типичного суффикса -ов/-ев, -ин, что указывает на её позднее закрепление или на то, что прозвище изначально бытовало в форме, близкой к нарицательной. В говорах слово «головега» могло звучать как «головяга» — отсюда вариативность написания. Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским землям, где такие «двусоставные» прозвища особенно характерны.

В отличие от фамилий, образованных от крестильных имён (Иванов, Петров), Головега сохранила прямую связь с живым народным языком. Носитель этой фамилии мог быть крестьянином или ремесленником, а его прозвище — не обидной кличкой, а узнаваемым «уличным» именем, под которым человека знала вся округа.