Фамилия Гонгорова — женская форма, мужской вариант — Гонгоров. Она образована по стандартной русской модели с помощью патронимического суффикса -ов, который в данном случае крепится к основе Гонгор. Эта основа не является ни крестильным именем, ни названием профессии, что сразу указывает на прозвищное происхождение.

Самая вероятная версия связывает фамилию с тюркским словом «гонгор» — колокольчик или бубенчик. В прошлом так могли прозвать звонкоголосого человека, болтуна, либо того, кто носил одежду с бубенцами, — например, скомороха или шута. В русских говорах слово «гонгор» встречается в значении «громкий говорун» или «крикун», что подтверждает звукоподражательную природу прозвища. В таком случае фамилия Гонгоров — это прозвище по характеру или поведению, данное предку.

Менее распространённая, но допустимая версия — от названия населённого пункта. В Забайкалье существует село Гонгора, а в Бурятии — урочище Гонгор. Если предки происходили из этих мест, фамилия могла стать топонимической, то есть указывать на выходца из Гонгоры. Однако для фамилий на -ов это менее типично: обычно такую модель давали по имени или прозвищу отца, а не по названию деревни.

Фамилия редкая и географически привязана к южным и восточным регионам России — встречается у казаков, в Ростовской и Астраханской областях, а также в Бурятии и Забайкальском крае. Встречаемость фамилии в документах XVIII–XIX веков невысока, что говорит о её локальном бытовании. Сословный состав — в основном крестьяне и однодворцы, но возможны и казачьи корни, учитывая ареал.

Написание с двумя «о» — Гонгорова — устойчиво, варианты вроде Гангарова или Гонгарова встречаются как ошибки или результат диалектного произношения. Ударение в фамилии обычно падает на второй слог: Гонго́рова.