Фамилия Гонопольская образована от прозвища Гонопольский, которое восходит к топониму Аннополь. Название Аннополь носило местечко в Острожском уезде Волынской губернии. Уже в 1761 году это местечко получило привилегию от польского короля Августа III. Здесь находились католическая часовня, 3 еврейских молитвенных дома, 5 постоялых дворов. Раньше местечко Аннополь называлось Глинники, но, перейдя 1761 году в собственность князей Яблоновских, получило это название от княгини Анны Яблоновской; Антон Яблоновский построил здесь замок и устроил парк, сын же его основал здесь униатскую церковь. В 1821 году, после пожара Острожского монастыря, Стефан Романовский, епископ Волынский, избрал Аннополь своим местопребыванием и перенес сюда духовную православную семинарию. В 1820 году в присутствии великого князя Константина Павловича здесь происходил смотр Литовского корпуса. Очевидно, основатель рода Гонопольских был выходцем из этой местности. Сведения о представителях фамилии Гонопольские содержатся в различных архивных документах. Так, в Книге памяти Иркутской области записаны евреи Гонопольский Борис Иосифович, который родился в 1890 году в Иркутске, и Гонопольский Ехиль Мейлихович, рожденный в 1869 году в местечке Шполы Киевской области. Среди известных обладателей этой фамилии – Игорь Марксович Гонопольский (род. в 1949), советский и казахский режиссер театра и кино.