Скорее всего, фамилия Гонзюс образована от прозвища Гонза, которое восходит к польскому слову gęsi - «гусиный». Вероятно, оно могло относиться к числу «профессиональных» и указывать на род занятий человека. Так, Гонзой могли называть того, кто разводил гусей или продавал их на рынке. Однако не исключено, что в основе этой фамилии лежит чешский вариант имени Иван — Гонза (Honza). Иван (в переводе с еврейского — «будет помилован) — распространённое славянское мужское имя. Оно довольно часто встречается среди болгар, македонцев, русских, сербов, словенцев, украинцев и хорват. Компонент -юс представляет собой усеченный вариант уменьшительного суффикса -юсь (существует и фамилия Гонзюсь). Фамилия Гонзюс встречается преимущественно на Украине. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Гонза, со временем получил фамилию Гонзюс.