Фамилия Гоовкина — женская форма фамилии Гоовкин, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем Гоовка. В основе лежит редкое диалектное слово «гоовка» — так в некоторых говорах могли называть человека с громким, зычным голосом, крикуна или запевалу. Слово образовано от глагола «го́вкать» (кричать, аукать, громко звать), родственного «говеть» (голосить, шуметь). Таким образом, первый носитель прозвища Гоовка был, скорее всего, обладателем сильного голоса — либо пастух, перекликавшийся в лесу, либо дьячок, либо просто бойкий и шумный человек.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Гоовкин буквально значит «сын Гоовки» или «человек из семьи Гоовки». Модель образования типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин широко распространены. В южнорусских и украинских землях на месте -ин чаще встречался бы суффикс -енко или -ук, так что география фамилии тяготеет к северу от Оки.

Интересная деталь: фамилия Гоовкин не упоминается в массовых справочниках и словарях русских фамилий (Унбегаун, Никонов, Веселовский), что говорит о её редкости. Скорее всего, она бытовала в одной-двух локальных группах, возможно, в староверческих сёлах или в глухих районах Архангельской, Вологодской или Костромской губерний. Там прозвища по голосовым особенностям были особенно устойчивы — в условиях, когда люди перекликались на дальних покосах или в лесу.

По сословной принадлежности носители фамилии могли быть как крестьянами, так и духовенством (низшие церковнослужители часто получали прозвища по голосу). Но в любом случае, Гоовкины — это потомки человека, чей голос выделял его среди других, и эта особенность закрепилась в фамилии на века.