Фамилия Гойса восходит к мусульманскому мужскому имени Гайса. Оно является татарским вариантом арабского Иса, которое переводится на русский язык как «милость божья». Маловероятно, что фамилия Гойса восходит к белорусскому «гайсаць», т.е. «бегать, скакать, резвиться». Однако в этом случае фамилия Гойса представляет собой застывшую форму прозвища, которое мог получить подвижный, жизнерадостный, активный человек. Появление «о» вместо «а» может объясняться влиянием на облик фамилии произносительной нормы русского языка.