Фамилия Графенин — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а социальный статус, и при этом статус не самого носителя, а его предка. Вопреки первому впечатлению, предок не был графом. Фамилию образовали от прозвища Графеня — так в народе могли назвать человека, который работал на графа: крепостного, управляющего, приказчика или дворового слугу. Суффикс -еня в русских прозвищах часто придавал оттенок ласкательности или принадлежности: Графеня буквально «графский человек», «графов». Фамильный суффикс -ин указывает на то, что фамилия отвечала на вопрос «чей?» — то есть сын или потомок Графени.

Вторая, менее вероятная версия выводит основу от личного имени Граф, которое могло быть сокращением от редкого календарного имени (например, Агриппа или Грациан). Но в быту русских крестьян и мещан имя Граф почти не встречалось, а прозвища по принадлежности помещику были обычным делом. Именно поэтому первая версия — рабочая и правдоподобная.

Фамилия Графенин — явно недворянская. В дореволюционных списках она встречается в основном среди крестьян и мещан центральных губерний России, особенно там, где были крупные графские поместья: в Тульской, Калужской, Орловской, Московской губерниях. Унбегаун в своих работах по русским фамилиям не упоминает Графенина, но модель образования «титул + -еня + -ин» типологически близка к фамилиям вроде Князев, Бояринов — только с иным суффиксом, что делает её более редкой.

Интересная деталь: фамилия Графенин не имеет «двойников» с суффиксом -ов (Графенов) в значимом количестве. Это указывает на то, что прозвище Графеня было локальным, а не общерусским. Если вы носите эту фамилию, ваши предки с высокой вероятностью были крепостными крестьянами или дворовыми людьми, приписанными к конкретному графскому имению — и фамилия закрепилась за ними как метка происхождения.