Фамилия Грапила — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В основе, скорее всего, не славянский корень, а искажённое или адаптированное на русской почве иностранное имя или прозвище. Суффикс -ила характерен для русских прозвищных фамилий, образованных от глаголов (как «Губила», «Крутила»), но в данном случае глагольная основа «грап-» не обнаруживается в русском языке. Это указывает на то, что перед нами, вероятно, фонетическая русификация.

Самая правдоподобная версия связывает фамилию с греческим именем Григорий (в просторечии — Грипила, Грипа). В греческих и южнославянских говорах звук «п» мог заменять «б» или «в», а окончание -ила — типичный для украинских, белорусских и южнорусских фамилий суффикс, означающий «сын такого-то» или просто носителя прозвища. Таким образом, Грапила могло быть производным от Грипила — «сын Григория» или «человек, которого звали Григорием». Менее вероятно, но возможно, что это переосмысление немецкой фамилии Grabe или Grabner, где корень означал «ров» или «могила», но в русском языке такое прозвище вряд ли прижилось бы из-за мрачного значения.

Географически фамилия тяготеет к западным и южным регионам бывшей Российской империи — Украине, Белоруссии, а также к казачьим областям. В дореволюционных метрических книгах единичные упоминания Грапила встречаются в Херсонской и Екатеринославской губерниях. Социальный статус носителей, судя по записям, — крестьяне или мещане, фамилия не дворянская. Носители фамилии могли быть потомками греческих переселенцев (например, из Приазовья) или выходцев из балканских земель, чьи имена и прозвища обрусели при записи в ревизские сказки.

В современной России фамилия крайне редка, её можно встретить в Краснодарском крае и Ростовской области — регионах, куда исторически шли потоки переселенцев с юга и запада. Других версий, например, от тюркского или финно-угорского корня, нет — они не подтверждаются ни формой, ни ареалом.