Фамилия Грнаткин — одна из тех, что сразу обращает на себя внимание необычным звучанием. В ней слышна иноязычная основа, и это не случайно. В русском ономастиконе фамилии с корнем «Грнат-» встречаются нечасто, и их происхождение почти всегда связано с западнославянскими языками, прежде всего с чешским и словацким.

Разбираем словообразовательную модель. Фамилия образована по стандартной русской модели с патронимическим суффиксом -ин. Он указывает на принадлежность: «чей?» — «Грнаткин», то есть сын или потомок человека по прозвищу Грнатка. Основа «Грнатк-» — это уменьшительная форма от чешского слова «hrnec» (горшок). В чешском языке «hrnčíř» означает гончар. Таким образом, Грнатка — это, скорее всего, ласкательное или обиходное прозвище гончара или человека, связанного с гончарным ремеслом. Прямая аналогия в русском языке — фамилия Горшков, но с той разницей, что в чешском «hrnec» звучит иначе.

География бытования фамилии подтверждает эту версию. Фамилия Грнаткин с высокой вероятностью встречается в регионах, куда в разное время переселялись чехи и словаки: это юг Украины (особенно Одесская и Запорожская области), Крым, а также отдельные районы Западной Сибири, куда ссылали участников чешского национального движения. В самой Чехии фамилия Hrnátka или Hrnatka существует, но с окончанием -ová у женщин. Переселенцы, адаптируясь к русской среде, русифицировали окончание, добавив -ин, что и дало современную форму.

Спорных версий немного. Иногда корень «Грнат-» пытаются связать с украинским словом «грань» или «гранат» (камень, плод), но это маловероятно: фонетически «грнат» не переходит в «грнатк» естественным путём в восточнославянских говорах. Чешское происхождение объясняет всё логично и без натяжек.

Социальный контекст. Носители фамилии Грнаткин в Российской империи, скорее всего, относились к мещанскому или крестьянскому сословию, но не к дворянству. Гончарное ремесло было городским и сельским промыслом, и прозвище Грнатка могло закрепиться за мастером, чьи горшки славились на всю округу. Фамилия не получила широкого распространения, поэтому каждый её носитель — хранитель довольно редкой для России западнославянской этимологической линии.