Фамилия Губаржевский — одна из тех, где внешне прозрачная основа обманчива. На первый взгляд в ней слышится «губа», но на деле корень, скорее всего, не русский, а западнославянский или украинско-белорусский. Суффикс -евский указывает на шляхетскую или польско-литовскую модель образования: так оформляли фамилии от названий поместий или прозвищ с прибавкой «-ski» (в русской передаче — «-ский»). Значит, первый носитель фамилии мог быть владельцем или уроженцем места под названием Губаржево, Губарж или Губаржев.

Самая правдоподобная версия происхождения основы — от слова губарж (gubarz). В польском и украинском диалектах это «губарь», то есть человек, который занимается губками — либо собирает лесные грибы-губки (трутовики), либо выделывает мочалки-губки из растительного сырья. Такое ремесло было не слишком престижным, но распространённым в лесных районах Волыни, Полесья, Подляшья. Менее вероятная, но не исключённая версия — связь с южнославянским «губа» (в значении «губа» как часть рта) в качестве прозвища за толстые или необычные губы. Однако для фамилии с суффиксом -евский прозвищная основа характерна меньше: такие фамилии чаще давали по месту жительства.

Географически фамилия Губаржевский крепко привязана к западу Украины и югу Беларуси, особенно к Волынской и Ровенской областям, а также к бывшим землям Речи Посполитой. В дореволюционных метриках и ревизских сказках она встречается среди православной и униатской шляхты, а также среди крестьян, получивших фамилию от названия хутора. В русском языке фамилия сохранила польское ударение на втором слоге: Губарже́вский, а не Губа́ржевский.

Редкость фамилии — в её суффиксе. В русской традиции такие модели на -жевский (как Губаржевский, Лубаржевский) встречаются намного реже, чем на -овский или -инский. Это выдаёт в предках носителя либо мелкую шляхту, либо переселенца с западных окраин империи, где польское влияние смешивалось с украинскими говорами. Если искать однокоренные «родственные» фамилии, то ближе всего будут Губарь, Губаренко, Губарев — но все они образованы по другой модели (с суффиксами принадлежности или отчества), а Губаржевский стоит особняком как топонимическая фамилия с польским оттенком.