Фамилия Губейко звучит как типичная украинская или белорусская фамилия, и это верно: её выдает суффикс -ейко. В восточнославянской ономастике этот суффикс (как и -айко, -ойко) характерен для фамилий, образованных от прозвищ или имён на территории нынешних Украины и Беларуси. Он выполнял роль уменьшительно-ласкательного или принадлежностного форманта, то есть буквально означал «маленький» или «сын такого-то». Так что Губейко — это «сын или потомок человека по прозвищу Губей» или просто «маленький Губа».

Основа фамилии — «губ-». В русских и украинских говорах слово «губа» имело не только прямое значение части лица. Прозвище Губа, а затем и Губей, могли дать человеку с толстыми, отвислыми или просто заметными губами. Но есть и вторая, менее очевидная версия: в некоторых диалектах «губа» означала «гриб» (отсюда «губка»), а «губей» — грибника или сборщика грибов. Третья возможность связана с глаголом «губить»: так могли прозвать человека, который что-то портил или вредил, хотя эта версия менее вероятна из-за негативного оттенка, который редко становился основой для фамилии без смягчения.

С точки зрения социального контекста, фамилии на -ейко в основном бытовали среди крестьян и мещан, реже — среди казаков. Они фиксировали прозвище первого носителя, которое со временем закрепилось за родом. Географически Губейко чаще всего встречается в западных областях Украины (Волынь, Подолье) и в южной Беларуси, что подтверждается современными данными о распространении фамилии.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает уточнить картину. Например, Губин (с русским суффиксом -ин) означает «чей-то?» — «сын Губы». Губенко (с украинским -енко) — это уже «сын Губы». А Губейко стоит особняком: суффикс -ейко в украинской традиции чаще встречается в уменьшительных формах (как в фамилиях Андрейко, Демейко), поэтому исходное прозвище Губей могло быть ласкательным или указывать на более молодого носителя. Таким образом, Губейко — не просто указание на предка с большой губой, а скорее на его потомка, которого в семье называли уменьшительно.