Фамилия Гудун — редкий пример, когда прозвище стало фамилией без добавочных суффиксов, то есть в «чистом» виде. Это так называемая непроизводная фамилия, характерная скорее для украинской, белорусской и южнорусской традиции, чем для северной, где преобладают формы на -ов и -ин. Такая модель указывает на то, что прозвище Гудун закрепилось за родоначальником напрямую, минуя этап отчества.

Сам корень прозвища восходит к глаголу «гудить», который в словаре Владимира Даля означает «порицать, корить, осуждать». В этом значении Гудуном могли прозвать строгого, требовательного человека, который постоянно читал нотации или выговаривал провинившимся. Однако у того же глагола есть и другое, музыкальное значение — «играть на гудке». Гудок — старинный русский смычковый инструмент, предок скрипки, и прозвище Гудун мог получить музыкант, зарабатывавший на жизнь игрой на этом инструменте.

Существует и третья версия — тюркская. В тюркских языках слово «гудун» означает «безрассудный», «безбашенный». В этом случае прозвище могло закрепиться за человеком легкомысленного или отчаянного нрава. Сложность в том, что без документальных свидетельств трудно определить, какая из версий верна для конкретной семьи, но все три гипотезы имеют равное право на существование.

В Книге памяти Республики Беларусь зафиксирован носитель фамилии — Гудун Афанасий Адамович, циркулярщик артели «Красный мебельщик», родившийся в 1909 году в деревне Жабино Старобинского района. Эта запись — редкое документальное подтверждение бытования фамилии в восточной Беларуси. Если ваши предки родом оттуда, скорее всего, фамилия имеет славянские корни, связанные либо с характером, либо с ремеслом.