Основой фамилии Гуенко послужило мирское имя Гуй. Нецерковное имя Гуй, предположительно происходит от слова «гуйка», что означает «большая гагара, водяной конь». Давая младенцу такое имя, как Гуй, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребенка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделено это животное. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Гуй, со временем получил фамилию Гуенко.