Фамилия Гупанов образована от прозвища или нецерковного имени Гупан. В основе лежит диалектное слово «гупан» — так в южнорусских и украинских говорах называли неуклюжего, нерасторопного человека, а также просто большого, грубоватого мужчину. В некоторых областях «гупаном» могли назвать и того, кто ходит в гуне — старой, изношенной одежде, отсюда переносное значение «бедно одетый, оборванец». Таким образом, фамилия относится к группе «характеристических»: предок получил прозвище по внешности, поведению или манере одеваться.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: Гупанов — сын Гупана. Фамилия закрепилась в среде крестьян и мещан, где прозвища были особенно распространены до отмены крепостного права. Интересно, что в некоторых говорах слово «гупан» имело и более нейтральное значение — «парень, детина», поэтому не исключено, что прозвище дали просто рослому молодому человеку без отрицательного оттенка.

По географии фамилия Гупанов тяготеет к югу России и востоку Украины. Встречается в Курской, Белгородской, Воронежской областях, а также в Ростовской области и Краснодарском крае — что подтверждает её диалектное происхождение. В более северных регионах фамилия редка, так как слово «гупан» там было малоупотребительно.

Родственные фамилии — Гупалов, Гупаленко, Гупановский — образованы от того же корня, но с разными суффиксами. Вариант Гупанов — самый распространённый, он фиксируется в документах XVII–XVIII веков, когда происходила массовая фиксация фамилий у крестьян. Никакой связи с дворянскими родами или знатным происхождением у этой фамилии нет — она чисто народная, бытовая.