Фамилия Гупанова образована от прозвища Гупан. В его основе, скорее всего, лежит украинский глагол «гупати» — «стукнуть, ударить, бить». Отсюда и два основных варианта происхождения фамилии. Первый — профессиональный: Гупаном могли прозвать плотника, строителя или мастера другого «шумного» ремесла, где работа сопровождается стуком. Второй — по характеру: «гупать» значит также «топать, бухать, громко хлопать», поэтому прозвище могло закрепиться за шаловливым, активным, шумным ребенком. Обе версии правдоподобны, так как прозвища в крестьянской и ремесленной среде часто давали либо по занятию, либо по заметной черте поведения.

Фамилия имеет типичную русскую модель с суффиксом -ов- и окончанием -а, указывающим на принадлежность женщине или на форму родительного падежа при ответе на вопрос «чья?». В документах встречаются упоминания о носителях фамилии в Курской области: Нестор Иванович Гупанов (1910 г. р.) и Анна Ивановна Гупанова (1910 г. р.). Эти записи подтверждают, что фамилия бытовала в южнорусских регионах, где влияние украинского языка и диалектов было особенно сильным. Таким образом, прозвище Гупан, а затем и фамилия Гупанова, скорее всего, возникли именно в этой языковой среде, где слово «гупати» было обиходным.