Фамилия Гуппе — редкий случай в русском ономастиконе, и её разбор стоит начать не с суффикса, а с самой основы. В русском языке нет корня «гупп-» со славянским происхождением. Поэтому первая версия, которая приходит в голову специалисту, — немецкое или еврейское (ашкеназское) происхождение. В немецком языке слово «Gupe» или «Guppe» исторически могло означать «шапка» или «чепец» (ср. с диалектным «Guppe» — головной убор). В таком случае фамилия образована от прозвища человека, который носил характерный головной убор, либо торговал ими. Это типичная модель для немецких фамилий, где прозвище переходило в наследственное имя без дополнительных суффиксов.

Вторая версия, более правдоподобная для восточноевропейского контекста, — искусственное или канцелярское происхождение. Фамилии на -е (Гуппе, Ренне, Массе) в Российской империи часто давали выходцам из немецких колоний или прибалтийским немцам. Священник или чиновник мог записать фамилию на слух, исказив немецкую «Gupp» или «Gupke». Кроме того, в среде российских немцев фамилия Гуппе фиксируется в Поволжье и на Волыни, где немецкие колонии существовали с XVIII века. Там она могла произойти от фамилии-патронима, где «-е» — это архаичный немецкий суффикс принадлежности (как русское «-ов»), указывающий на сына человека по имени Гупп.

С точки зрения словообразования, фамилия стоит в ряду так называемых «окаменелых» форм: она не склоняется по русским падежам как типичные фамилии на -ов/-ев, а остаётся неизменной. Это указывает на её позднее заимствование в русский язык и на то, что носители, скорее всего, были людьми грамотными, городскими или военными, а не крестьянами из центральной России. Если предки вашего собеседника носили фамилию Гуппе, то с высокой вероятностью они были немецкими колонистами, лютеранами, занимавшимися ремеслом или сельским хозяйством в обособленных поселениях.

Учитывая редкость фамилии, в дореволюционных справочниках она почти не встречается среди дворянства. Это фамилия «третьего сословия»: мещан, цеховых мастеров, аптекарей или учителей. В современной России Гуппе встречается единично, чаще всего у потомков тех самых поволжских немцев, которые после депортации 1941 года расселились по Сибири и Казахстану.