Фамилия Гургенбеков — яркий пример сложносоставной модели, характерной для народов Кавказа и Закавказья. Она образована от армянского мужского имени Гурген и тюркского титула «бек» (князь, господин). Таким образом, основа Гургенбек буквально означает «господин Гурген» или «князь Гурген». Имя Гурген, в свою очередь, восходит к древнеперсидскому «Вркана» — так называлась историческая область Гиркания на юго-восточном побережье Каспийского моря; в армянской традиции это имя закрепилось как Гурген.

Русский суффикс -ов, добавленный к основе, типичен для фамилий, которые оформлялись по русской административной модели в XIX–XX веках. Это значит, что носитель фамилии или его отец носили имя или прозвище Гургенбек, и при переходе в русскоязычную среду (например, при записи в метрические книги, воинские списки или паспорта) фамилия получила стандартное окончание -ов.

Интересно, что в самой Армении и в Грузии фамилии на -беков встречаются реже, чем в среде армян, живших в составе Российской империи на Северном Кавказе или в Закавказье. Там титул «бек» нередко указывал на принадлежность к привилегированному сословию — мелкопоместным дворянам или уважаемым старейшинам. Поэтому предки носителей фамилии Гургенбеков, скорее всего, были людьми знатного происхождения или занимали видное положение в местной общине.

В отличие от многих русских фамилий, образованных от крестильных имён, Гургенбеков — случай, где имя и титул слились в одно слово ещё до того, как стали фамилией. Подобные конструкции (например, Ашотбеков, Мурадбеков) встречаются в основном у армян, азербайджанцев и народов Дагестана, что делает эту фамилию маркером определённой этносоциальной группы.