Фамилия Гургенов — один из характерных примеров того, как русская модель фамилии на -ов усвоила нерусское личное имя. В основе лежит армянское мужское имя Гурген. В армянской традиции это имя восходит к древнеперсидскому Varkena, что означает «волк»; в исторических источниках оно известно с раннего Средневековья, его носили армянские цари и князья из династии Багратуни.

Словообразовательная модель проста: к имени Гурген добавили русский патронимический суффикс -ов, который в русских фамилиях отвечает на вопрос «чей?» — то есть «сын Гургена». Такая конструкция типична для фамилий, возникших в среде, где русская администрация или церковь фиксировала армян по отчеству. Это не армянская фамилия в собственном смысле (в Армении патронимы образуются суффиксами -ян/-янц), а русская по форме, армянская по корню.

Исторически носители фамилии Гургенов — это, скорее всего, потомки армян, переселившихся в Российскую империю в XVIII–XIX веках, особенно после присоединения Восточной Армении (1828 год). Они могли быть купцами, ремесленниками или священнослужителями, но точных данных о сословной принадлежности нет — фамилия не указывает на дворянство или крестьянство, она просто фиксирует имя предка.

Встречается фамилия в основном на юге России, в Краснодарском и Ставропольском краях, в Ростовской области, а также в Москве и Санкт-Петербурге — то есть там, где исторически сложились крупные армянские общины. Варианты написания редки, но возможна форма Гургенян — уже по собственно армянской модели, если семья сохранила исходный суффикс.

Однокоренные фамилии — Гургенян, Гургеновский (встречается у русских, возможно, от прозвища Гурген). Само имя Гурген в качестве прозвища у русских почти не фиксируется, так что версия о чисто русском происхождении фамилии от прозвища маловероятна.