Фамилия Гусейханов — яркий пример того, как русская модель фамилии (суффикс -ов) накладывается на восточное личное имя. Её основа — составное мусульманское имя Гусейхан, которое, в свою очередь, образовано слиянием двух компонентов: «Гусейн» и «хан».

Имя Гусейн (Хусейн) — арабского происхождения, уменьшительная форма от имени Хасан, означающая «хороший», «красивый». Это имя внука пророка Мухаммеда, чрезвычайно почитаемого в исламе, особенно у шиитов. Вторая часть — «хан» — тюркский титул, который в составе личных имён часто выполнял роль уважительного компонента, подчёркивавшего знатность, благородство или просто благочестие носителя. Таким образом, имя Гусейхан можно истолковать как «благородный Гусейн» или «господин, подобный Хусейну».

Фамилия Гусейханов, вероятнее всего, сформировалась в среде народов Кавказа или Поволжья, где были распространены тюркские языки и ислам. Суффикс -ов указывает на то, что фамилия оформлялась по русскому образцу — скорее всего, при переписи населения или при получении документов в XIX — начале XX века. Первым носителем фамилии стал человек, которого звали Гусейхан, а его дети и потомки получили фамилию, означающую «принадлежащие Гусейхану», «из рода Гусейхана».

Важно отметить, что фамилия не указывает напрямую на ханское происхождение. Компонент «хан» в личных именах был настолько популярен, что со временем превратился просто в часть имени, не неся сословного смысла. Предок современных Гусейхановых мог быть и крестьянином, и ремесленником, и воином — имя Гусейхан встречалось в самых разных слоях общества. Фамилия достаточно редкая, и её география в основном привязана к регионам традиционного проживания лезгинских, аварских, даргинских и других народов Дагестана, а также Азербайджана.