Фамилия Гуссоева — редкий случай, когда географический адрес почти наверняка перевешивает все прочие версии. Носители фамилии, как правило, осетины, и корень здесь не в гусенице или гусе, а в осетинском языке. Основа — мужское имя Гуссо (Гусса), которое в свою очередь восходит к арабскому Хусейн (уменьшительная форма от Хасан) через тюркское посредничество. В осетинском языке звук «х» на стыке с гласными часто переходил в «г» или выпадал, поэтому Хусейн превратился в Гуссо.

Фамилия образована по типичной для осетин модели: к имени Гуссо добавили русский суффикс принадлежности -ев (фонетический вариант -ов после мягкого согласного). Получилось Гуссоев — «сын Гуссо», «из рода Гуссо». Женская форма Гуссоева — это вариант, указывающий на замужнюю женщину или дочь из этого рода, и в русской паспортной системе она закрепилась как неизменяемая фамилия.

В осетинской среде фамилия распространена в Дигорском ущелье (Северная Осетия). Сами осетины-дигорцы часто произносят её с ударением на первый слог — Гу́ссоева, что тоже служит маркером происхождения. В отличие от многих русских фамилий, где суффикс -ев мог присоединяться к прозвищу по профессии, здесь мы видим чисто патронимическую модель: предок был назван в честь мусульманского имени, которое через Кавказ пришло вместе с исламом.

Встречается также вариант написания с одной «с» — Гусоева. Это не ошибка, а следствие того, что в осетинском языке долгота согласного не имеет смыслоразличительного значения, и при записи в русских документах двойную «с» могли не фиксировать. Однако в современном бытовании двойное «сс» — основной и более точный вариант, сохраняющий структуру исходного имени Гуссо.