Фамилия Гуссоев звучит на русский лад благодаря суффиксу -ов, но её корень выдает нерусское, скорее всего, кавказское происхождение. В основе фамилии лежит имя Гуссо (Гусо, Гусса), которое могло быть уменьшительной или диалектной формой от осетинского имени Гусс или от арабского Хусейн (в местном произношении — Гусейн). На Кавказе, особенно в Осетии, звук «х» часто заменялся на «г», поэтому Гусейн превращался в Гуссо, а затем в фамилию Гуссоев.

Вероятнее всего, фамилия образована по осетинской модели: к личному имени Гуссо прибавили русский патронимический суффикс -ов, который в XIX—XX веках активно усваивался осетинами при оформлении фамилий в документах. Таким образом, Гуссоев буквально означает «сын Гуссо» или «потомок Гуссо».

Менее вероятна, но возможна версия, связывающая фамилию с тюркским словом «гус» (птица) или с иранским «гус» (ухо), но в таком случае ожидалась бы иная суффиксальная модель (например, Гусов). Поэтому осетинский или общекавказский след с именем Гуссо — наиболее правдоподобный.

Фамилия редкая и узко локализована: большинство носителей Гуссоевых — осетины, живущие в Северной Осетии (особенно в Дигорском ущелье) и в Южной Осетии. Встречается она и среди ингушей, что объясняется историческими переселениями и смешением родов. В русских метрических книгах фамилия почти не фиксируется — это дополнительный аргумент в пользу её кавказских корней.

Интересная деталь: в осетинском языке ударение в фамилии Гуссоев падает на второй слог (Гуссо́ев), а в русской среде часто смещается на первый (Гу́ссоев). Это типичный пример адаптации иноязычной фамилии к русской фонетике.