Фамилия Гюльбекова — одна из тех, где сложное имя предка «законсервировалось» почти без изменений. В её основе лежит составное тюркское имя Гюльбек (или Гульбек), и разобрать его несложно. Первая часть — «гюль» (от персидского «голь») означает «цветок», «роза», а в тюркской традиции это ещё и устойчивый символ красоты, изящества, непорочности. Вторая часть — «бек»: тюркский титул, переводимый как «князь», «повелитель», «господин», «начальник».

Соединившись, эти две части дают имя, которое можно истолковать как «господин, подобный цветку» или «князь-цветок». Скорее всего, так назвали мальчика в семье, где ценили не только знатное происхождение или богатство, но и внешнюю привлекательность. Впрочем, «бек» в составе имени мог указывать и на реальное социальное положение предка — уважаемого человека, главу рода или зажиточного хозяина.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ов, который присоединили к основе Гюльбек-. Притяжательный суффикс указывает на принадлежность: Гюльбекова — «дочь (или жена) Гюльбека». В среде, где фамилии давали по отцу, это типичный патроним, закреплённый за потомками. Говорить о точном месте возникновения фамилии без генеалогических изысканий сложно: процесс формирования фамилий у разных народов Российской империи растянулся на столетия, и окончательные выводы требуют работы с документами конкретной семьи.