Фамилия Иклер — редкий для России случай, когда немецкая основа не получила славянского суффикса. В отличие от большинства переселенческих фамилий, которые на русской почве обрастали окончаниями -ов или -ин, Иклер сохранила исходную форму. Это сразу указывает на её позднее появление в России: скорее всего, в XVIII–XIX веках, когда немецкие колонисты массово селились в Поволжье, Причерноморье и на Волыни.

Корень фамилии — немецкое Ickler, и здесь есть две версии происхождения. Первая, наиболее прямая: от средневерхненемецкого ickel — «ёж». В таком случае Иклер — прозвище колючего, неуживчивого человека или же того, кто занимался ловлей и продажей ежей (в немецких землях их мясо и иглы использовали в народной медицине). Вторая версия связывает фамилию с топонимом: в Германии есть несколько населённых пунктов с названием Ickelheim или Icking, и суффикс -er в немецких фамилиях часто обозначал выходца из такой местности («икльский»). Оба объяснения правдоподобны, но прозвищное кажется более вероятным — фамилии от названий животных в немецкой ономастике встречаются чаще, чем топонимические с таким редким корнем.

Фамилия Иклер практически не встречается в центральных и северных регионах России. Её география — зоны бывших немецких колоний: Самарская и Саратовская области, Оренбуржье, отчасти Алтай (куда немцев депортировали в 1941 году). В дореволюционных метрических книгах носители фамилии фиксировались как лютеране или католики, а после 1917 года — как советские граждане немецкого происхождения. Среди известных носителей нет громких имён, что типично для фамилий, не успевших «обрусе́ть» и остававшихся в замкнутых общинах.

Словообразовательно фамилия проста: основа Ick(e)l + суффикс деятеля -er. В русском языке она не склоняется по падежам, если принадлежит мужчине (Иван Иклер), и склоняется как существительное второго склонения, если речь о женщине (Анна Иклер). Изредка встречается вариант написания Иклёр — с ударением на последний слог, что может быть следствием немецкого произношения или позднейшей русификации.