Фамилия Илдаркина хранит память о личном имени дальнего предка. Она образована от имени Илдарка — скорее всего, уменьшительной, бытовой формы татарского мужского имени Илдар (в русской записи чаще Ильдар). Имя Илдар составное: «ил» — страна, родина, «дар» — держать, владеть. В сумме — «руководитель страны», «правитель» или «владыка». Нарекая сына таким именем, родители желали ему большого будущего, власти и уважения.

Фамилия строится по простой русской модели: к основе Илдарк- добавляется суффикс принадлежности -ин, указывающий на родство: «чей?» — Илдаркин. Окончание -а в современном написании — это женская форма (в мужском варианте фамилия звучит как Илдаркин). Такая модель (-ин) в русских фамилиях обычно закреплялась за основами, оканчивающимися на -а или -я, что и произошло с именем Илдарка.

В отличие от более распространённых фамилий на -ов/-ев, фамилия Илдаркина встречается редко и имеет заметный региональный и этнический отпечаток. Она типична для зон русско-татарского пограничья и территорий, где издавна жили крещёные татары или обрусевшие мусульмане. Суффикс -к- в основе (Илдарка) выдает неофициальную, домашнюю речь: так в русской деревне могли называть татарина или человека с татарскими корнями, переделывая его имя на свой лад.

Таким образом, фамилия Илдаркина — один из примеров того, как тюркское имя прошло через русское бытовое словообразование и закрепилось в фамилии по стандартной схеме. Потомок человека по имени Илдарка, независимо от его реального социального статуса, со временем стал писаться как Илдаркин.