Фамилия Ильдеркина восходит к мужскому тюркскому имени Ильдар, которое в переводе на русский язык означает «имеющий родину», «руководитель страны, правитель». В основу фамилии легла уменьшительная русифицированная форма этого имени, распространенная среди чувашей — Ильдерка. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Ильдеркиных можно лишь на основании генеалогических исследований.