Фамилия Ильягуева образована от мужского имени Ильягу — одного из вариантов древнееврейского имени Элиягу. В буквальном переводе это имя означает «Он — Бог мой». Элиягу — библейский пророк Илия (Илья), которого почитают в иудаизме, христианстве и исламе. Согласно еврейской традиции, пророк был взят на небо живым и вернется перед приходом Машиаха; в христианстве он известен как Илья-пророк.

Фамилия Ильягуева встречается преимущественно на Кавказе, что указывает на вероятную принадлежность основателя рода к горским евреям. Эта этническая группа сохранила древние еврейские имена в форме, близкой к оригиналу, тогда как в русской среде то же имя трансформировалось в Илья и дало фамилии Ильин, Ильиных. Суффикс -ев в фамилии Ильягуева — типичный русский патронимический формант, который присоединялся к основе при оформлении фамилий в документах. Таким образом, перед нами не чисто еврейская фамилия, а имя библейского происхождения, адаптированное по русской словообразовательной модели.

Интересно, что ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Илья́гуева. Это отличает её от фамилий, образованных от имени Илья, где ударным часто бывает первый слог. Сама основа Ильягу — это не полное имя, а краткая или обиходная форма от Элиягу, подобно тому как в русском языке от полного имени Дмитрий образуется форма Митя.