Фамилия Ильюхина — это классический пример того, как народная речь переработала церковное имя в бытовое прозвище, а затем закрепила его в качестве родового имени. В основе лежит мужское крестильное имя Илья, которое в свою очередь восходит к древнееврейскому Элияху (Eliyahu). Переводится это имя как «мой Бог — Господь», то есть «мой Бог — Бог истинный», и в библейской традиции принадлежит одному из самых почитаемых пророков.

Фамилия образована не напрямую от полной формы Илья, а от его просторечного, обиходного варианта — Ильюха. Суффикс -юх- в русских именах (ср. Марьюха, Матюха) придавал имени оттенок фамильярности или принадлежности к простому, незнатному кругу. Поэтому основатель рода Ильюхиных, скорее всего, был выходцем из крестьянской или мещанской среды, где такие формы имен были повседневной нормой.

Суффикс -ин в окончании фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — «сын Ильюхи». Это типичная модель для центральных и северных регионов России. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые могли носить и дворяне, фамилии на -ин чаще закреплялись за непривилегированными сословиями, что косвенно подтверждает версию о простом происхождении предка.

Интересно, что имя Элияху, от которого всё пошло, в разных культурах дало множество форм: в английском это Элайджа, в арабском — Ильяс, а в русском языке закрепился вариант Илья через греческое посредничество. Фамилия Ильюхина — один из самых «русских» вариантов этого библейского имени, сохранивший в себе живую разговорную интонацию.