Фамилия Ильюша — редкий случай, когда в основе лежит не полное, а уменьшительное имя. Её образовали напрямую от народной формы Ильюша, производной от крестильного имени Илья. Илья, в свою очередь, восходит к библейскому имени Eliyahu, которое с древнееврейского переводят как «мой Бог — Господь», то есть «мой Бог — Бог истинный». Так что фамилия Ильюша буквально означает «сын Ильюши» или «потомок того, кого звали Ильюшей».

Обычно русские фамилии образуются от канонической формы имени (Ильин) или от разговорных вариантов вроде Илюхин или Ильюхин. Ильюша — более ласкательный, почти домашний вариант, который закрепился в качестве фамилии. Это говорит о том, что прозвище Ильюша давали человеку в быту, возможно, в кругу семьи или близких соседей, и оно прижилось настолько, что перешло к детям.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: основа Ильюш- плюс нулевое окончание. Фамилия не имеет типичных фамильных суффиксов (-ов, -ев, -ин), что встречается реже. Такие «чистые» фамилии без суффикса чаще фиксировались на Украине и в южных регионах России, но в случае с Ильюша нельзя исключать и западнорусское или белорусское происхождение. В ономастических справочниках эта фамилия не столь распространена, как Ильин, но встречается в рассеянных очагах — от Смоленщины до Кубани.

Социальный контекст: если предок носил прозвище Ильюша, он мог быть из крестьянской или мещанской среды, где уменьшительные имена часто становились уличными прозвищами, а затем и фамилиями. В дворянской среде такое вряд ли закрепилось бы — там предпочитали полные формы.

Спорных версий происхождения у этой фамилии нет: библейский корень очевиден, а форма Ильюша — живое народное сокращение. Единственное, что можно добавить: в некоторых говорах Ильюшей могли называть не только человека по имени, но и того, кто походил на библейского Илью-пророка характером или внешностью, но это уже предположение без надёжных источников.

Так что, встретив фамилию Ильюша, вы имеете дело с прямой отсылкой к домашнему имени предка — тёплой, почти интимной детали семейной истории, которая сохранилась в официальном родовом имени.