Фамилия Индеев — одна из тех, что хранит в себе редкое церковное имя. В её основе лежит имя Индей, а оно, в свою очередь, восходит к греческому Индис, что значит «индейский». Это имя попало в святцы благодаря мученику Индису Никомидийскому. Модель образования проста и привычна для русского ономастикона: к основе имени Индей добавили типичный фамильный суффикс -ев, указав на принадлежность роду человека по имени Индей («чей?» — Индеев).

Имя Индей — нечастое, и фамилия, соответственно, тоже встречается не повсеместно. В Книге памяти Нижегородской области сохранилась запись о красноармейце Индееве Дмитрии Семеновиче, 1910 года рождения, уроженце села Шеф-Майдан Сасовского района Рязанской области. Эта географическая привязка показательна: Шеф-Майдан находится в зоне распространения так называемых «мордовских» фамилий, где суффикс -ев (а не -ов) часто возникает под влиянием местных говоров. Не исключено, что корни фамилии уходят в регионы, где смешивались русские и финно-угорские традиции имянаречения, а редкое календарное имя Индис могло прижиться именно в такой среде.