Фамилия Индеева — одна из тех, что образована от личного имени, а не от прозвища или профессии. В её основе лежит имя Индей, которое является просторечной, бытовой формой редкого христианского имени Индис. Само имя Индис восходит к греческому слову, означающему «индейский», и попало в святцы благодаря мученику Индису Никомидийскому, пострадавшему за веру в раннехристианский период.

Имя Индей в дореволюционной России встречалось нечасто, и принадлежало оно, судя по всему, людям из простого сословия — крестьянам или посадским. Сложная суффиксальная модель здесь не нужна: фамилия образована по стандартной притяжательной схеме с суффиксом -ев. Вопрос «чей?» давал ответ «Индеев» — то есть сын, потомок человека по имени Индей. Со временем форма закрепилась в женском роде как Индеева, под которую и попали все носительницы фамилии.

Географически фамилия тяготеет к центральным и поволжским регионам России, что типично для имён, бытовавших в крестьянской среде. В отличие, скажем, от фамилий на -ский, которые часто указывали на дворянское или духовное происхождение, Индеева — яркий пример «простонародной» модели: имя + патронимический суффикс без дополнительных социальных маркеров.

Споров о происхождении здесь почти нет. Версия с греческим Индисом — основная и наиболее обоснованная, поскольку имя зафиксировано в святцах. Альтернативные гипотезы, связывающие фамилию с тюркскими корнями (например, «индюк» или «инди» — «так»), выглядят натянутыми и не подтверждаются ни исторической фонетикой, ни географией распространения. Так что с высокой долей вероятности предки современных Индеевых — это люди, носившие редкое церковное имя, которое в быту сократили до привычного Индей.