Фамилия Инин — одна из тех, что образована от уменьшительной формы крестильного имени. В основе лежит имя Ина — сокращение от Иннокентий. Латинское innocens переводится как «невинный», но история имени парадоксальна: в Древнем Риме его носили императоры и полководцы, не отличавшиеся кротким нравом. Получается, что предок носителя фамилии мог быть назван Иннокентием по святцам, а в быту звался просто Иной.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — «Инин», то есть сын, потомок Ины. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от личных имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я. Родственные фамилии из того же гнезда — Инкин, Инков, Иннокентьев, Иношин, Инчин, Иншаков, Иншин, Иньшин, Инютин, Инюшин, Иняхин. Все они восходят к разным народным формам того же канонического имени.

Среди известных носителей — писатель и драматург Аркадий Инин. В целом фамилия встречается нечасто, но равномерно по разным регионам России, без резкой привязки к одной местности.