Фамилия Исачкины (в мужском роде — Исачкин) образована от имени собственного, что типично для русских фамилий. В основе лежит крестильное имя Исаак, которое пришло на Русь вместе с христианством. В переводе с древнееврейского это имя означает «смеющийся» или «она засмеялась» — библейская отсылка к реакции Сарры, матери Исаака, которая рассмеялась, услышав пророчество о рождении сына в глубокой старости.

Фамилию образовали не от полной церковной формы, а от народной, обиходной — Исачок. Суффикс -ок в русских именах часто служил для создания уменьшительно-ласкательных или просторечных вариантов (сравните: Иван — Ивашок, Пётр — Петрок). От этого прозвищного имени Исачок через притяжательный суффикс -ин и появилась фамилия Исачкин: буквально «сын Исачка». Окончание -ы (Исачкины) — это форма множественного числа, характерная для обозначения целого рода или семьи.

О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно: процесс формирования фамилий у разных сословий растянулся на несколько столетий, с XV по XIX век. Однако модель с суффиксом -ин считается одной из древнейших в северных и центральных русских землях. В отличие от более поздних фамилий на -ов/-ев, которые часто давались по отцу (Иванов — сын Ивана), фамилии на -ин могли указывать на принадлежность к конкретному человеку по имени, иногда с более личным оттенком.

Интересная деталь: при всей библейской древности имени Исаак, фамилия Исачкин встречается не так часто, как, скажем, Иванов или Петров. Это говорит о том, что имя Исаак не было повсеместно популярным в народе, а бытовало в основном в среде духовенства или старообрядцев, где чаще обращались к ветхозаветным именам. Таким образом, предки современных Исачкиных, скорее всего, были или церковнослужителями, или выходцами из среды, где строго следовали церковному календарю.